Seorang pria tak dikenal (Matt Damon) ditemukan terapung di laut, hidup tapi tanpa ingatan. Saat ingatannya perlahan pulih, ia menyadari dirinya adalah Jason Bourne—seorang pembunuh bayaran dengan masa lalu gelap. Dengan bantuan Marie (Franka Potente), Bourne melintasi Eropa untuk mengungkap identitasnya, sementara musuh tak terlihat memburunya tanpa ampun. Setiap langkahnya dihantui bahaya, dan kebenaran yang ia cari mungkin lebih mematikan daripada lupa.