Sepuluh tahun setelah invasi Naboo, Senator Padmé Amidala menjadi target pembunuhan. Obi-Wan Kenobi dan Anakin Skywalker ditugaskan melindunginya, tapi misi ini mengungkap konspirasi yang lebih besar: pasukan klon rahasia dan gerakan Separatis. Sementara Anakin jatuh cinta pada Padmé dan diliputi mimpi buruk tentang ibunya, Obi-Wan mengejar bounty hunter Jango Fett ke Geonosis. Siapakah dalang di balik semua ini? Dan bisakah Anakin menahan amukannya sebelum terlambat?
