Setelah dua tahun terpisah, Mystery Inc. dipertemukan kembali di Spooky Island, sebuah taman hiburan yang menyimpan rawa gelap. Pengunjung muda berubah menjadi zombie, dan hanya Scooby dan kawan-kawan yang bisa mengungkap kebenarannya. Tapi bisakah mereka mengesampingkan ego dan menyelamatkan hari?