Di jantung cerita ini ada Caesar (Andy Serkis), simpanse yang mendapatkan kecerdasan dan emosi layaknya manusia berkat obat eksperimental. Dibesarkan seperti anak oleh pencipta obat, Will Rodman (James Franco) dan primatolog Caroline Aranha (Freida Pinto), Caesar akhirnya direnggut dari manusia yang dicintainya dan dipenjara di suaka kera di San Bruno. Mencari keadilan untuk sesama penghuni, Caesar memberikan obat yang sama kepada kera-kera lain, lalu memimpin pasukan simian untuk melarikan diri—memicu bentrokan dahsyat antara manusia dan kera yang bisa mengubah planet selamanya.