Ash dan Pikachu bertualang bersama Lizabeth, keturunan Suku Air, dan Jackie, seorang Pokémon Ranger, untuk melindungi telur Manaphy—Sang Pangeran Laut—dari cengkeraman bajak laut jahat. Legenda Kuil Laut dan mahkota misteriusnya mengantar mereka pada petualangan bawah air yang epik. Akankah kekuatan persahabatan mengalahkan niat gelap si Phantom?