Terlempar ke masa lalu oleh chakra misterius, Naruto tiba di Kota Loran yang penuh teka-teki. Di sana, ia bertemu dengan sosok tak terduga yang terkait dengan masa depannya. Dengan waktu yang terus berkurang, Naruto harus memecahkan misteri kota itu dan menghentikan rencana jahat sebelum garis waktu hancur.