Sepuluh tahun lalu, Dr. Hell dan Kekaisaran Bawah Tanahnya nyaris menghancurkan umat manusia, hingga Koji Kabuto bangkit dengan robot legendaris, Mazinger Z, dan menghentikan rencana jahat mereka. Kini, Koji telah meninggalkan kehidupan sebagai pilot dan menjadi ilmuwan seperti ayahnya. Namun, kedamaian itu hancur ketika ancaman baru yang lebih mengerikan muncul dari dasar Gunung Fuji, memaksanya kembali ke kokpit Mazinger Z. Di tengah pertarungan antara kebaikan dan kejahatan, nasib manusia tergantung pada pilihannya—siapakah yang akan menang?