Neo terjebak di antara Matrix dan dunia nyata sementara Zion bersiap untuk perang terakhir melaku mesin. Sahabatnya berusaha membebaskannya dari cengkeraman The Merovingian, percaya dialah satu-satunya harapan untuk mengakhiri perang. Namun, ancaman baru muncul dari pihak ketiga yang mengincar kehancuran kedua dunia. Akankah Neo bisa menghentikan kehancuran sebelum semuanya terlambat?
