Tahun 2027, pasca Perang Dunia IV non-nuklir, sebuah bom meledak di Newport City, menewaskan pedagang senjata yang diduga terkait organisasi misterius 501. Motoko Kusanagi, hacker jenius dengan tubuh cybernetik, disewa oleh Daisuke Aramaki untuk mengungkap konspirasi ini. Dalam dunia di mana identitas dan kebenaran bisa direkayasa,