Shirou Emiya, magi muda yang polos, terjebak dalam Perang Cawan Suci—pertarungan maut antara para penyihir dan Servant mereka. Namun, segalanya berubah ketika "Bayangan" misterius muncul, membunuh tanpa ampun. Shirou harus memilih: menyelamatkan orang yang dicintainya atau menghentikan kekacauan yang mengancam Fuyuki. Bisakah dia mengubah takdir sebelum semuanya terlambat?