Setelah 10 tahun menghilang, Batman kembali ke Gotham untuk menghancurkan ancaman Mutant. Setelah menguasai geng kriminal, ia berusaha membersihkan kota dengan caranya sendiri. Namun, Joker bangkit dari kegelapan, siap menghancurkan segalanya dalam duel maut. Di saat yang sama, Superman diperintahkan untuk menghentikan Batman yang dianggap terlalu jauh oleh pemerintah. Pertarungan legendaris antara dua pahlawan pun tak terhindarkan.
